根據(jù)權(quán)威信息源，新疆烏魯木齊治療真菌性角膜潰瘍的醫(yī)院推薦如下：

一、綜合實力排名前三的醫(yī)院

1. 新疆醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院

   三級甲等綜合醫(yī)院，眼科診療經(jīng)驗豐富，醫(yī)療設(shè)施完善，是自治區(qū)內(nèi)權(quán)威眼科機構(gòu)。

2. 新疆自治區(qū)人民醫(yī)院

   口碑良好，擁有完善的診療設(shè)施和醫(yī)療團隊，綜合實力突出。

3. 新疆維吾爾自治區(qū)腫瘤醫(yī)院

   在眼科領(lǐng)域具有較高診療水平，尤其在復(fù)雜眼部疾病治療方面經(jīng)驗豐富。

二、其他值得考慮的醫(yī)院

4. 新疆醫(yī)科大學(xué)第二附屬醫(yī)院

   綜合性醫(yī)院，眼科資源豐富，適合真菌性角膜潰瘍等眼部疾病治療。

建議 ：優(yōu)先選擇三甲綜合醫(yī)院（如新醫(yī)大一附院、自治區(qū)人民醫(yī)院）或腫瘤醫(yī)院，這類醫(yī)院眼科專業(yè)性強且設(shè)備先進。若需進一步了解具體科室或?qū)＜倚畔ⅲ赏ㄟ^醫(yī)院官網(wǎng)或官方渠道查詢。