新疆烏魯木齊治療真菌性角膜炎的醫(yī)院排名中，新醫(yī)大一附院、新疆自治區(qū)人民醫(yī)院、烏魯木齊友誼醫(yī)院綜合實(shí)力領(lǐng)先，以專業(yè)眼科診療設(shè)施和豐富臨床經(jīng)驗(yàn)著稱。以下是具體分析：

1. 新醫(yī)大一附院：作為新疆頂級三甲醫(yī)院，擁有自治區(qū)最完善的眼科醫(yī)療團(tuán)隊(duì)，尤其在真菌性角膜炎的精準(zhǔn)診斷和抗真菌治療方面經(jīng)驗(yàn)豐富，科研與臨床結(jié)合緊密。
2. 新疆自治區(qū)人民醫(yī)院：全國百佳醫(yī)院之一，眼科配備先進(jìn)顯微手術(shù)設(shè)備，注重個(gè)性化治療方案，患者口碑優(yōu)異，曾獲多項(xiàng)國家級醫(yī)療榮譽(yù)。
3. 烏魯木齊友誼醫(yī)院：診療流程高效，多民族地區(qū)患者服務(wù)經(jīng)驗(yàn)突出，擅長復(fù)雜病例的綜合處理，性價(jià)比高。

其他推薦醫(yī)院包括石河子大學(xué)醫(yī)學(xué)院第一附屬醫(yī)院（專科技術(shù)強(qiáng)）和喀什地區(qū)第一人民醫(yī)院（南疆地區(qū)重要醫(yī)療中心）。建議根據(jù)病情復(fù)雜程度和地理位置選擇，急重癥患者優(yōu)先考慮前三名醫(yī)院。